172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22790  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  100 
 
 
123 aa  245  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30650  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  61.16 
 
 
121 aa  141  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.782601  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0160  PhnA protein  60.5 
 
 
117 aa  140  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.542327  hitchhiker  0.0000205972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2382  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.64 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00334109  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0170  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.5 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.747936  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0322  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  63.03 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0378499  hitchhiker  0.00000000814869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0282  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  60.66 
 
 
112 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.249322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3817  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.85 
 
 
112 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4739  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  59.5 
 
 
114 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191551  normal  0.436041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3090  putative alkylphosphonate uptake protein, phnA  59.32 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5080  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4812  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
120 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4654  alkylphosphonate utilization operon protein  55.08 
 
 
120 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4674  alkylphosphonate utilization operon protein  55.08 
 
 
120 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0863  PhnA protein  56.78 
 
 
124 aa  127  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.563096  normal  0.644817 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5177  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5082  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01560  hypothetical protein  58.97 
 
 
113 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5051  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5085  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
113 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0204  hypothetical protein  58.97 
 
 
113 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0160  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.24 
 
 
113 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0998  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA, putative  58.47 
 
 
124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.29749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4761  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.24 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3770  hypothetical protein  56.2 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0801  PhnA protein  55.93 
 
 
113 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0444  alkylphosphonate uptake protein  53.39 
 
 
122 aa  123  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.39 
 
 
113 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4624  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  62.1 
 
 
121 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2614  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.26 
 
 
134 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0717  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  57.14 
 
 
113 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0125807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3549  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.72 
 
 
110 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1698  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.93 
 
 
112 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000832125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1081  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.41 
 
 
113 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.406917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3438  hypothetical protein  55.08 
 
 
113 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67162  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1381  PHNA protein alkylphosphonate uptake  55.56 
 
 
113 aa  120  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0582  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.67 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0686  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.46 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4499  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  58.12 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.902658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0958  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.1 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0565299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1102  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.1 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1791  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.24 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0411  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.78 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2525  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
112 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0215423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4848  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  54.7 
 
 
130 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2938  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.94 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2430  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.85 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2239  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.69 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18100  PhnA protein  57.26 
 
 
114 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2184  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.74 
 
 
112 aa  117  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0718  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  56.3 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6473  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  55.08 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal  0.219152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4862  PhnA protein  55 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1219  hypothetical protein  50.85 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00756508  normal  0.430256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3129  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50 
 
 
113 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2595  phnA family protein  50.85 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2068  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.69 
 
 
113 aa  114  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.818906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2917  phnA family protein  50.85 
 
 
112 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0097  hypothetical protein  52.14 
 
 
113 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0089  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.72 
 
 
112 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1492  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.17 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.301207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1928  hypothetical protein  49.17 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.035098  normal  0.423433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1380  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.17 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0570  PhnA protein  55.08 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.595887  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1478  PhnA protein  50.85 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2498  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  53.85 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00301412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1749  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.18 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.717201  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1339  alkylphosphonate uptake protein  50 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.319385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4249  putative Zn-ribbon-containing protein involved in phosphonate metabolism, PhnA-like protein  50.43 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435311  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0919  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  49.57 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0311  hypothetical protein  47.86 
 
 
111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0235836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0516  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  51.28 
 
 
113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4551  hypothetical protein  47.01 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4684  hypothetical protein  47.01 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4635  hypothetical protein  47.01 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4544  hypothetical protein  47.01 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4635  hypothetical protein  47.01 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4283  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  50.85 
 
 
113 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0946  phnA protein  50.43 
 
 
109 aa  107  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000317474  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0904  PhnA-like protein  50.43 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000000773889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3334  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.74 
 
 
113 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1540  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.33 
 
 
113 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.776148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0976  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.74 
 
 
113 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5621  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.15 
 
 
137 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4573  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.15 
 
 
137 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03979  hypothetical protein  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3884  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4348  hypothetical protein  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4662  hypothetical protein  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03940  hypothetical protein  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3919  hypothetical protein  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4609  hypothetical protein  46.15 
 
 
111 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0433  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  52.46 
 
 
112 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1931  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.93 
 
 
114 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00764196  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0340  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  48.31 
 
 
113 aa  100  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1476  PhnA protein  50 
 
 
116 aa  100  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2533  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  45.9 
 
 
113 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1233  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.93 
 
 
114 aa  97.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1092  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  47.11 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1248  alkylphosphonate utilization operon protein PhnA  46.15 
 
 
113 aa  94.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>