169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4008 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4008  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  223  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.455402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3510  hypothetical protein  98.26 
 
 
115 aa  219  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2629  hypothetical protein  83.48 
 
 
114 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3447  hypothetical protein  74.78 
 
 
113 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5267  hypothetical protein  75.86 
 
 
113 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600229  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  51.85 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  50 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  48.39 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  62.75 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6178  hypothetical protein  54.05 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  62.75 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  43.56 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4597  hypothetical protein  57.14 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  44.44 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  60.78 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  46.03 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  43.06 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  43.06 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  43.06 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  57.14 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  43.96 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  53.06 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  36.44 
 
 
109 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6203  hypothetical protein  52.46 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0901  hypothetical protein  55.38 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  45.83 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  42.05 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1255  hypothetical protein  56.72 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154904  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5972  hypothetical protein  47.46 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0827  hypothetical protein  38.04 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2514  hypothetical protein  38.04 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2375  hypothetical protein  38.04 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0421  hypothetical protein  51.85 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  49.3 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0470  hypothetical protein  51.85 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1799  hypothetical protein  51.85 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  47.46 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  47.46 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  47.46 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  47.46 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  47.46 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2625  hypothetical protein  44.79 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269693  normal  0.125731 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  47.46 
 
 
102 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5099  hypothetical protein  43.48 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0579686  hitchhiker  0.00698414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  54.17 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0632  hypothetical protein  36.96 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.472438  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3242  hypothetical protein  57.14 
 
 
108 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.481595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2209  hypothetical protein  47.46 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  47.46 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  40.51 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0912  hypothetical protein  41.77 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0266951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0900  hypothetical protein  41.77 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  39.24 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  39.24 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5118  hypothetical protein  48.48 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2361  hypothetical protein  38.55 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4716  hypothetical protein  59.57 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110015  normal  0.0160912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0995  hypothetical protein  52.08 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5640  hypothetical protein  38.54 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232494  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  46.27 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  46.27 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  65.85 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0468  hypothetical protein  48.48 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3206  hypothetical protein  48.48 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5082  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516272  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  57.14 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4557  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36871  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5161  hypothetical protein  48.48 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0961668  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3494  hypothetical protein  41.38 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.274336  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  57.14 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6555  hypothetical protein  51.79 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.831358  normal  0.817546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  55.1 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1677  hypothetical protein  45.78 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5354  hypothetical protein  40.91 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  58.7 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  57.14 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7182  hypothetical protein  45 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.11331  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  57.14 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4734  hypothetical protein  46.03 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254908  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1351  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0956  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2478  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  44.23 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0335  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0613  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76614  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1289  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.58939  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1217  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4881  hypothetical protein  38.89 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000223725  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0711  hypothetical protein  63.41 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.438996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  36.78 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6010  hypothetical protein  35.8 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17376  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2086  hypothetical protein  35.8 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  36.78 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2067  hypothetical protein  35.8 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  36.78 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5707  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  46.15 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6071  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.939472  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0091  hypothetical protein  57.5 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>