62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1417 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1417  organic radical activating enzyme family protein  100 
 
 		 177 aa  360  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6412  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  358  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7072  radical SAM domain-containing protein  99.44 
 
 		 214 aa  357  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.707686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5699  organic radical activating enzyme family protein  78.53 
 
 		 214 aa  279  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2529  putative radical activating enzyme  54.02 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28910  putative radical activating enzyme  54.02 
 
 		 212 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.57089  hitchhiker  0.000000412693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6431  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1110  putative radical activating enzyme  33.51 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0318169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6955  putative radical activating enzyme  31.88 
 
 		 229 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14950  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  36.07 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2694  putative radical activating enzyme  33.33 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1547  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34.82 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1259  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34.71 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1000  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  36.36 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03520  hypothetical protein  25.44 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.399946  normal  0.740791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3391  pyruvate formate-lyase activating enzyme  32.46 
 
 		 249 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1019  putative anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.57 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1055  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.42 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3289  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.32 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3589  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.58 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0126  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.64 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2826  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.56 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.63 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.98 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  27.98 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.63 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.63 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  29.63 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0703  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.58 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000608251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2512  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.56 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  29.63 
 
 		 243 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.75 
 
 		 243 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0694  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  39.76 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4810  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.63 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  27.38 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2251  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.56 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000659535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.04 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0337007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3309  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein; organic radical activating enzyme  28.04 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05714  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.52 
 
 		 112 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3628  putative anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.04 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000287308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  29.63 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5283  Radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1605  putative anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.04 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0164109  hitchhiker  0.00000000823422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3710  putative anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.04 
 
 		 150 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000161258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3613  putative anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.04 
 
 		 150 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1616699999999998e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3359  formate acetyltransferase activating enzyme ([pyruvate formate-lyase]-activating enzyme) (PFL activase)  28.04 
 
 		 150 aa  44.3  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000152733  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0049  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase activating protein  35.37 
 
 		 177 aa  44.3  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.887207  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4772  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562953  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.74 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.458489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2045  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34.31 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0350  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.09 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4602  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2082  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.71 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1945  anaerobic ribonucleotide reductase activator  35.71 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1943  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16515  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1601  anaerobic ribonucleotide reductase-activating protein  28.81 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3692  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.07 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3048  anaerobic ribonucleotide reductase-activating protein  28.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185473  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  29.27 
 
 		 240 aa  41.2  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2570  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  39.53 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4034  anaerobic ribonucleotide reductase-activating protein  31.07 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3557  anaerobic ribonucleotide reductase-activating protein  31.07 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>