17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6303 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1526  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.818031  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6303  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  662    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.519477 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6961  XRE family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.512084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1093  XRE family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 280 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0788  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2650  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00061055  normal  0.037615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0552  Cro/CI family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.213682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0134  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2990  hypothetical protein  30.12 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35470  hypothetical protein  30.12 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.030822  hitchhiker  0.00555849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0540  Cro/CI family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0531  Cro/CI family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 269 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0497  Cro/CI family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 269 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4501  helix-turn-helix domain protein  27.38 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0769508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2182  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 264 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293373  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0872  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>