37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1382 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1261  hypothetical protein  78.45 
 
 
655 aa  880    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1923  hypothetical protein  72.03 
 
 
656 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.216966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1360  hypothetical protein  98.41 
 
 
656 aa  1204    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0847107 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1294  hypothetical protein  78.89 
 
 
655 aa  898    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.01238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1382  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1224    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0494817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0900  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1225    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4528  hypothetical protein  87.42 
 
 
656 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373387  normal  0.198235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0794  hypothetical protein  61.11 
 
 
709 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0630  hypothetical protein  53.2 
 
 
775 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2143  hypothetical protein  60.63 
 
 
752 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2010  hypothetical protein  60.07 
 
 
754 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190144  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0688  hypothetical protein  60.07 
 
 
754 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2229  hypothetical protein  60.1 
 
 
754 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1587  hypothetical protein  59.9 
 
 
754 aa  555  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2253  hypothetical protein  35.39 
 
 
582 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703915  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3524  hypothetical protein  35.92 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4000  cellulose biosynthesis protein BcsE  33.33 
 
 
378 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03337  hypothetical protein  33.33 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.362213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0180  putative protease  33.33 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0076  cellulose biosynthesis protein BcsE  27.73 
 
 
524 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03384  hypothetical protein  33.33 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4902  hypothetical protein  33.33 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0177  cellulose biosynthesis protein BcsE  33.33 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3845  hypothetical protein  32.81 
 
 
519 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.725838 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3895  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  33.99 
 
 
501 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3939  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  33.99 
 
 
519 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.636302  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3817  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  33.99 
 
 
519 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.663757  normal  0.0560415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3831  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  33.99 
 
 
519 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0079  cellulose biosynthesis protein BcsE  29.3 
 
 
534 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3933  putative cytoplasmic protein  30.03 
 
 
520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.147057  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3999  hypothetical protein  33.99 
 
 
519 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366924  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0145  hypothetical protein  29.58 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2132  hypothetical protein  27.7 
 
 
496 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0935  hypothetical protein  23.72 
 
 
515 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3202  putative protease  28.28 
 
 
496 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2630  hypothetical protein  28.44 
 
 
284 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>