37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3524 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3524  hypothetical protein  100 
 
 
571 aa  1152    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2253  hypothetical protein  55.52 
 
 
582 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703915  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1294  hypothetical protein  36.01 
 
 
655 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.01238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1261  hypothetical protein  35.63 
 
 
655 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1360  hypothetical protein  35.96 
 
 
656 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0847107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0900  hypothetical protein  35.96 
 
 
656 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1382  hypothetical protein  35.96 
 
 
630 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0494817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4528  hypothetical protein  35.79 
 
 
656 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373387  normal  0.198235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1923  hypothetical protein  35.49 
 
 
656 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.216966 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0630  hypothetical protein  37.2 
 
 
775 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0794  hypothetical protein  35.95 
 
 
709 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2143  hypothetical protein  36.88 
 
 
752 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1587  hypothetical protein  36.24 
 
 
754 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2010  hypothetical protein  36.24 
 
 
754 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190144  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0688  hypothetical protein  36.24 
 
 
754 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2229  hypothetical protein  36.56 
 
 
754 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3933  putative cytoplasmic protein  27.86 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.147057  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3817  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  28.74 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.663757  normal  0.0560415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3895  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  28.45 
 
 
501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3831  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  28.45 
 
 
519 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3939  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  28.45 
 
 
519 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.636302  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4024  hypothetical protein  26.63 
 
 
501 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3999  hypothetical protein  28.45 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366924  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0177  cellulose biosynthesis protein BcsE  26.63 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4902  hypothetical protein  26.63 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03337  hypothetical protein  26.63 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.362213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0180  putative protease  26.63 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03384  hypothetical protein  26.63 
 
 
523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3845  hypothetical protein  26.35 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.725838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0076  cellulose biosynthesis protein BcsE  25.43 
 
 
524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4000  cellulose biosynthesis protein BcsE  27.49 
 
 
378 aa  123  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0079  cellulose biosynthesis protein BcsE  30.42 
 
 
534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0935  hypothetical protein  24.67 
 
 
515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0145  hypothetical protein  25.92 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2630  hypothetical protein  32.14 
 
 
284 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2132  hypothetical protein  32.14 
 
 
496 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3202  putative protease  32.94 
 
 
496 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>