38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0079 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0076  cellulose biosynthesis protein BcsE  88.01 
 
 		 524 aa  956    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0079  cellulose biosynthesis protein BcsE  100 
 
 		 534 aa  1088    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0145  hypothetical protein  54.46 
 
 		 522 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3933  putative cytoplasmic protein  42.49 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.147057  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3831  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  42.71 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3939  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  42.71 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.636302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3999  hypothetical protein  42.49 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3817  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  42.49 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.663757  normal  0.0560415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0177  cellulose biosynthesis protein BcsE  42.55 
 
 		 519 aa  381  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03337  hypothetical protein  42.55 
 
 		 523 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.362213  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4902  hypothetical protein  42.34 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0180  putative protease  42.55 
 
 		 519 aa  382  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03384  hypothetical protein  42.55 
 
 		 523 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3895  putative cellulose biosynthesis protein BcsE  42.26 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3845  hypothetical protein  41.79 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.725838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4024  hypothetical protein  42.16 
 
 		 501 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4000  cellulose biosynthesis protein BcsE  46.48 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2132  hypothetical protein  35.86 
 
 		 496 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0914278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3202  putative protease  34.61 
 
 		 496 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2630  hypothetical protein  41.77 
 
 		 284 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.902729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0935  hypothetical protein  28.17 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2253  hypothetical protein  29.75 
 
 		 582 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0794  hypothetical protein  30.7 
 
 		 709 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1923  hypothetical protein  30.94 
 
 		 656 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.216966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1360  hypothetical protein  28.71 
 
 		 656 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0847107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1382  hypothetical protein  29.97 
 
 		 630 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0494817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0900  hypothetical protein  29.97 
 
 		 656 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1294  hypothetical protein  29.6 
 
 		 655 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372498  normal  0.01238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1261  hypothetical protein  29.67 
 
 		 655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4528  hypothetical protein  27.89 
 
 		 656 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0373387  normal  0.198235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3524  hypothetical protein  30.42 
 
 		 571 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0630  hypothetical protein  30.08 
 
 		 775 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316737  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2143  hypothetical protein  30.08 
 
 		 752 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137262  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0688  hypothetical protein  30.28 
 
 		 754 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1587  hypothetical protein  30.28 
 
 		 754 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592502  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2010  hypothetical protein  30.28 
 
 		 754 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2229  hypothetical protein  30.28 
 
 		 754 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2629  hypothetical protein  33.88 
 
 		 256 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>