18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1204 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0724  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1204  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4312  hypothetical protein  94.37 
 
 
142 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000185847  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1087  hypothetical protein  86.62 
 
 
142 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1177  hypothetical protein  95.77 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000175133  normal  0.224878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1087  hypothetical protein  89.44 
 
 
142 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2099  hypothetical protein  82.86 
 
 
153 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1504  hypothetical protein  57.94 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1375  hypothetical protein  57.94 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1371  putative lipoprotein  57.94 
 
 
151 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.155118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1785  hypothetical protein  57.01 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0696  hypothetical protein  57.01 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000138286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1173  hypothetical protein  57.01 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0456  hypothetical protein  57.01 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2863  hypothetical protein  57.01 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.253112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1605  hypothetical protein  36.23 
 
 
157 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2864  hypothetical protein  35.34 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1757  hypothetical protein  42.16 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.615876  normal  0.679103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>