18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1087 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1087  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4312  hypothetical protein  87.32 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000185847  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1087  hypothetical protein  95.77 
 
 
142 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1177  hypothetical protein  85.21 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000175133  normal  0.224878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0724  hypothetical protein  86.62 
 
 
142 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1204  hypothetical protein  86.62 
 
 
142 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2099  hypothetical protein  78.57 
 
 
153 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1504  hypothetical protein  53.27 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1371  putative lipoprotein  53.27 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.155118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1375  hypothetical protein  53.27 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1785  hypothetical protein  56.84 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0696  hypothetical protein  56.84 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000138286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0456  hypothetical protein  56.84 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1173  hypothetical protein  56.84 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2863  hypothetical protein  52.34 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.253112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1605  hypothetical protein  39.68 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2864  hypothetical protein  37.4 
 
 
157 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1757  hypothetical protein  47.78 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.615876  normal  0.679103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>