18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1087 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1087  hypothetical protein  95.77 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4312  hypothetical protein  88.73 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000185847  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1177  hypothetical protein  88.03 
 
 		 142 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000175133  normal  0.224878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0724  hypothetical protein  89.44 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1204  hypothetical protein  89.44 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2099  hypothetical protein  78.57 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1504  hypothetical protein  53.27 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1371  putative lipoprotein  53.27 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.155118  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1375  hypothetical protein  53.27 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1785  hypothetical protein  56.84 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0696  hypothetical protein  56.84 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000138286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1173  hypothetical protein  56.84 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0456  hypothetical protein  56.84 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2863  hypothetical protein  52.34 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.253112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1605  hypothetical protein  37.68 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2864  hypothetical protein  37.59 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1757  hypothetical protein  47.78 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.615876  normal  0.679103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>