18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1375 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1375  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1504  hypothetical protein  99.34 
 
 
173 aa  276  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0878118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0696  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000138286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1785  hypothetical protein  98.68 
 
 
173 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1173  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1371  putative lipoprotein  98.01 
 
 
151 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.155118  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2863  hypothetical protein  93.48 
 
 
151 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.253112  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0456  hypothetical protein  98.32 
 
 
132 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2864  hypothetical protein  42.62 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1605  hypothetical protein  41.46 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1757  hypothetical protein  39.74 
 
 
156 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.615876  normal  0.679103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4312  hypothetical protein  51.56 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000185847  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1177  hypothetical protein  53.27 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000175133  normal  0.224878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0724  hypothetical protein  52.17 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1204  hypothetical protein  52.17 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2099  hypothetical protein  53.85 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513584  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1087  hypothetical protein  47.83 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1087  hypothetical protein  52.87 
 
 
142 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>