14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0678 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0678  type III secretion protein HpaP  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2280  type III secretion protein HpaP  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2197  type III secretion protein HpaP  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0752  type III secretion inner membrane protein SctQ  89.11 
 
 		 202 aa  333  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1629  type III secretion inner membrane protein SctQ  100 
 
 		 645 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1956  type III secretion inner membrane protein SctQ  100 
 
 		 645 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0636  type III secretion inner membrane protein SctQ  100 
 
 		 645 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1906  type III secretion protein HpaP  32.14 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1998  type III secretion protein HpaP  31.53 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191968  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5642  hypothetical protein  37.23 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79123  normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5859  hypothetical protein  31.45 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5930  hypothetical protein  37.39 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0314797 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0862  Hrp associated protein HPAP  39.82 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.382848  normal  0.199451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>