9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4957 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4957  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.208491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4245  hypothetical protein  32.77 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0121178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1371  sigma-24 (FecI-like)  28.74 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2880  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0227  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4789  hypothetical protein  26.32 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3325  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  28.57 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0206  sigma-24 (FecI-like)  23.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6609  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  23.78 
 
 		 180 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>