9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1413 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3467  peptidase  46.15 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6392  hypothetical protein  40.41 
 
 		 197 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2538  hypothetical protein  41.91 
 
 		 218 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3594  hypothetical protein  39.71 
 
 		 198 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2042  hypothetical protein  40.5 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.196025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2175  hypothetical protein  37.6 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3406  hypothetical protein  37.72 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2497  peptidase  27.61 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>