11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9599 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9599  conjugal transfer protein TraH  100 
 
 		 211 aa  437  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8135  conjugal transfer protein TraH  51.92 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4305  conjugal transfer protein TraH  48.26 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670535  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4543  conjugal transfer protein TraH  48.26 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7067  conjugal transfer protein TraH  48.08 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9193  conjugal transfer protein TraH  51.92 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5511  conjugal transfer protein TraH  48.79 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167812 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7537  lytic transglycosylase catalytic  30.87 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75484  normal  0.0515023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2355  Lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4379  lytic transglycosylase, catalytic  30.53 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5089  transport secretion system IV, VirB1 protein  33.04 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>