17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6004 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6004  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1251  hypothetical protein  34.58 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1819  hypothetical protein  32.58 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0974773  decreased coverage  0.000815621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1609  hypothetical protein  36.28 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2014  hypothetical protein  34.57 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_004310  BR1661  hypothetical protein  38.32 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6997  hypothetical protein  27.83 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0622  hypothetical protein  30.86 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3567  protein of unknown function DUF883, ElaB  27.73 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1806  protein of unknown function DUF883, ElaB  32.61 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.55805  normal  0.0781076 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4113  protein of unknown function DUF883, ElaB  28.7 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1387  hypothetical protein  47.62 
 
 		 165 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0288  protein of unknown function DUF883 ElaB  34.74 
 
 		 106 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.166783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0878  protein of unknown function DUF883, ElaB  27.08 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  29.13 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  29.13 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>