16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1661 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1661  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  225  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1251  hypothetical protein  82.05 
 
 
117 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1609  hypothetical protein  95.73 
 
 
113 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6004  hypothetical protein  38.32 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2342  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0917446  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2767  hypothetical protein  28.21 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1806  protein of unknown function DUF883, ElaB  31.58 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.55805  normal  0.0781076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6997  hypothetical protein  28.04 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0651  hypothetical protein  25.81 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2014  hypothetical protein  33.67 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4113  protein of unknown function DUF883, ElaB  26.85 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2025  hypothetical protein  30.61 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3567  protein of unknown function DUF883, ElaB  25.93 
 
 
123 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1819  hypothetical protein  31.96 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0974773  decreased coverage  0.000815621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3104  protein of unknown function DUF883, ElaB  35.87 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0622  hypothetical protein  31.52 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>