14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1089 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  190  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1646  hypothetical protein  47.25 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.19 
 
 		 92 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3536  hypothetical protein  47.19 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2462  hypothetical protein  43.82 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003303  hypothetical protein  52.63 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22850  hypothetical protein  44.57 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.81234  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1864  hypothetical protein  52.38 
 
 		 50 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.73 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>