13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0231 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0231    100 
 
 
306 bp  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2973    95.45 
 
 
189 bp  71.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1328  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  100 
 
 
1146 bp  60  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0238  lanthionine synthetase C-like  100 
 
 
3177 bp  56  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0581031  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2238  hypothetical protein  89.58 
 
 
183 bp  56  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  100 
 
 
2550 bp  54  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1473  transglutaminase-like  100 
 
 
2262 bp  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.647705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  100 
 
 
381 bp  52  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1192  hypothetical protein  91.89 
 
 
177 bp  50.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30045  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  100 
 
 
999 bp  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81430  meiosis-specific protein  100 
 
 
1824 bp  46.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0511  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiE  96.3 
 
 
1233 bp  46.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3592  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
2091 bp  46.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.800679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>