22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5065 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5065  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0222136  normal  0.603351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  44.95 
 
 
385 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  46.77 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  27.32 
 
 
819 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  56.14 
 
 
737 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3362  hypothetical protein  49.12 
 
 
404 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  46.3 
 
 
178 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  46.3 
 
 
178 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  32.91 
 
 
755 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0214  Cation transport ATPase-like protein  29.35 
 
 
526 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
723 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  32.89 
 
 
169 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 
743 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
770 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
805 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  45.28 
 
 
380 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  39.66 
 
 
628 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  39.29 
 
 
703 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  22.12 
 
 
400 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3555  hypothetical protein  33.71 
 
 
286 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0363608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  33.33 
 
 
400 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>