25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2172 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  818    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  94.25 
 
 
400 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  52.63 
 
 
169 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  40.26 
 
 
628 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  39.47 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  37.66 
 
 
178 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  40.98 
 
 
178 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  46.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0214  Cation transport ATPase-like protein  32.94 
 
 
526 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  45.9 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
819 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
743 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  28.81 
 
 
210 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
805 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  38.6 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
737 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  31 
 
 
716 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3555  hypothetical protein  38.64 
 
 
286 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0363608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.31 
 
 
770 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0546  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
766 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
723 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0757  hypothetical protein  28.17 
 
 
154 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.479528  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3362  hypothetical protein  34.55 
 
 
404 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5065  hypothetical protein  22.12 
 
 
235 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0222136  normal  0.603351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  26.79 
 
 
752 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>