20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3362 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3362  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  31.6 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  30.88 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
737 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
755 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5065  hypothetical protein  49.12 
 
 
235 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0222136  normal  0.603351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  43.1 
 
 
178 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  43.1 
 
 
178 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0214  Cation transport ATPase-like protein  38.24 
 
 
526 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  31.13 
 
 
723 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  36.11 
 
 
169 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
743 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 
819 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
805 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  34.55 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  31.87 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  34.55 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  27.27 
 
 
628 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  31.58 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  38.18 
 
 
703 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>