28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3953 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3953  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.162282  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1221  hypothetical protein  56.36 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2354  hypothetical protein  42.22 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1557  hypothetical protein  40 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0710655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0822  hypothetical protein  48.28 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0794  hypothetical protein  48.28 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0228  hypothetical protein  44.64 
 
 
169 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461046 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2001  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
829 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.790447  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2172  hypothetical protein  46.43 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.103435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2416  hypothetical protein  46.03 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2568  hypothetical protein  37.29 
 
 
178 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.9304  normal  0.567584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3546  hypothetical protein  37.29 
 
 
178 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3005  E1-E2 ATPase-associated domain protein  39.29 
 
 
628 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2997  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
819 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
737 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
805 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
723 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 
743 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0225  hypothetical protein  34.29 
 
 
370 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.780759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2077  hypothetical protein  39.29 
 
 
210 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3362  hypothetical protein  34.55 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3555  hypothetical protein  38.89 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0363608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2725  hypothetical protein  35.85 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  hitchhiker  0.00312453 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0030  hypothetical protein  36 
 
 
172 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  32.86 
 
 
703 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  35.9 
 
 
716 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5066  hypothetical protein  37.5 
 
 
385 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0931999  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5065  hypothetical protein  38.89 
 
 
235 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0222136  normal  0.603351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>