16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1376 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1376  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  793    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 
417 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
410 aa  46.2  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
432 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
274 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
417 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
413 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2103  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
405 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>