16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4354 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008538  Arth_4354  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0303102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.94 
 
 
261 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.24 
 
 
349 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.23 
 
 
354 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.23 
 
 
261 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  24.55 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  25.91 
 
 
358 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.22 
 
 
349 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.87 
 
 
259 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.44 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  23.94 
 
 
364 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  25.13 
 
 
352 aa  46.2  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  25.23 
 
 
349 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.04 
 
 
365 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.81 
 
 
372 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.18 
 
 
358 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>