12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1043 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1043  ubiquitin-associated- domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  373  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00290  UBA/TS-N domain-containing protein  68.54 
 
 		 180 aa  266  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000331222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2232  ubiquitin-associated- domain-containing protein  34.19 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1055  UBA/TS-N domain-containing protein  31.35 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1054  UBA/TS-N domain-containing protein  26.7 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0735587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1536  ubiquitin-associated domain-containing protein  25.28 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.450314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1347  ubiquitin-associated domain-containing protein  27.97 
 
 		 136 aa  47.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000690799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3056  ubiquitin-associated- domain-containing protein  21.12 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.275328  hitchhiker  0.00000312149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12470  hypothetical protein  24.62 
 
 		 124 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2474  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000687328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3049  hypothetical protein  22.63 
 
 		 141 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0255915  normal  0.0152403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  31.11 
 
 		 312 aa  41.2  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>