12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2478 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 396 aa  784    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000277513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2052  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.68 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8397  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.967626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  32.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6617  hypothetical protein  30.43 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.61 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3148  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 135 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  43.9 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5052  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 135 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 782 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.62 
 
 		 280 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>