48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_R0036 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0032  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000101474  normal  0.0845198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06610  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.506381 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06600  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.513034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13130  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0983321  normal  0.642579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0053  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000949911  hitchhiker  0.00166028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0052  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125474  normal  0.521924 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0019  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00642302  normal  0.417435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0036  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01380  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0844385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0018  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.780391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0020  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0817304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0013  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114392  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0048  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00910953  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0046  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0009  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0004  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>