34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0393 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0393  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  319  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0421  hypothetical protein  86.34 
 
 
160 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0422  hypothetical protein  86.34 
 
 
160 aa  215  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4672  hypothetical protein  45.1 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22674  normal  0.0530626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3788  hypothetical protein  32.08 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0370713  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05524  hypothetical protein  36.11 
 
 
123 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4280  putative lipoprotein  34.26 
 
 
119 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4601  putative lipoprotein  33.62 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4119  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
118 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1765  putative lipoprotein  26.72 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0225927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3888  putative lipoprotein  28.97 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4222  putative lipoprotein  29.9 
 
 
117 aa  51.2  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.831557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2722  putative lipoprotein  29 
 
 
118 aa  51.2  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1450  putative lipoprotein  28 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4013  putative lipoprotein  30.21 
 
 
117 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.567759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3205  hypothetical protein  27.36 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1338  putative lipoprotein  29 
 
 
133 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1494  hypothetical protein  25.74 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01775  lipoprotein  32.63 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00909333  normal  0.58691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1389  putative lipoprotein  27.27 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3083  putative lipoprotein  28.04 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0108  hypothetical protein  28.04 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3969  putative lipoprotein  28.04 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1652  putative lipoprotein  28.04 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3466  putative lipoprotein  28.04 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0049  putative lipoprotein  29.41 
 
 
117 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1130  integrase/recombinase  32.08 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0881  lipoprotein  31.63 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00580  putative lipoprotein  28.43 
 
 
117 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.342793  normal  0.195116 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1456  lipoprotein  29.13 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5338  hypothetical protein  28 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1251  hypothetical protein  24.32 
 
 
125 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2760  hypothetical protein  29.13 
 
 
125 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3428  hypothetical protein  29.13 
 
 
125 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>