46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1851 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1851  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3702  hypothetical protein  36.63 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3842  protein of unknown function DUF485  37.23 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3759  protein of unknown function DUF485  37.23 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  32.29 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  31.58 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  30.85 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  31.96 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  27.37 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  32.56 
 
 
101 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  32.67 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0314  protein of unknown function DUF485  27.47 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8526  protein of unknown function DUF485  32.1 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1156  hypothetical protein  34.18 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198714  normal  0.266062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  27.84 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  30.11 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  25.27 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1315  protein of unknown function DUF485  32.91 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  31.25 
 
 
104 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1541  protein of unknown function DUF485  31.18 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000112878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1561  protein of unknown function DUF485  32.91 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  31.25 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  30.11 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  30.59 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  26.47 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>