80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8526 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8526  protein of unknown function DUF485  100 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1561  protein of unknown function DUF485  64.29 
 
 		 98 aa  130  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1156  hypothetical protein  65.31 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198714  normal  0.266062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1315  protein of unknown function DUF485  64.29 
 
 		 98 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  38.3 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0314  protein of unknown function DUF485  37.08 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  35.11 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  33.73 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  34.48 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  34.15 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  32.22 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  37.21 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  37.21 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  37.21 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  34.12 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  32.56 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  39.51 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  39.51 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  34.88 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  34.88 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  36.05 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  29.9 
 
 		 101 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3702  hypothetical protein  31.71 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  37.21 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  34.12 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3842  protein of unknown function DUF485  31.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3759  protein of unknown function DUF485  31.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  38.27 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  35.53 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5645  hypothetical protein  35.06 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0407513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  31.76 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  28.92 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  28.92 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  29.41 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  34.21 
 
 		 128 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5956  hypothetical protein  34.09 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3376  protein of unknown function DUF485  35.11 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3261  protein of unknown function DUF485  32.98 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2489  hypothetical protein  35.87 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0275  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  31.33 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  31.33 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  28.41 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3230  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  27.27 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2813  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0638  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0474  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0454  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1387  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0206  hypothetical protein  30.95 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  30.49 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  27.27 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  27.91 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  31.33 
 
 		 102 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  28.57 
 
 		 117 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4961  hypothetical protein  34.52 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249965  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4011  hypothetical protein  30 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  24.47 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  25.29 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  24.72 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  23.96 
 
 		 119 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1541  protein of unknown function DUF485  35.37 
 
 		 104 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000112878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0397  hypothetical protein  29.63 
 
 		 101 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>