15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3993 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_3993  ribonuclease H  100 
 
 
314 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.552096 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4122  ribonuclease H  40.96 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3267  ribonuclease H  45.1 
 
 
169 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.272769  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  42.59 
 
 
159 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02661  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
1538 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.468774  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  31.76 
 
 
160 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0160  ribonuclease H  31.97 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47083  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  29.41 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  36.63 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4372  Ribonuclease H  25.17 
 
 
163 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4434  Ribonuclease H  25.17 
 
 
163 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1142  ribonuclease H  28.74 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0027  ribonuclease H  30.72 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  46 
 
 
142 aa  43.1  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02711  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 
666 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.397796  normal  0.291664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>