23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3039 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3039  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0615593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2945  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2858  hypothetical protein  97.79 
 
 
181 aa  336  9e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00197139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2787  hypothetical protein  75.69 
 
 
181 aa  266  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114614  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0006  Zn-dependent protease  29.71 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0006  peptidase zinc-dependent  28.57 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0006  peptidase zinc-dependent  30.3 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0006  peptidase zinc-dependent  29.14 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.655175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1753  peptidase zinc-dependent  28.12 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0329  archaemetzincin-like protein  30.23 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1552  peptidase zinc-dependent  29.76 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1868  peptidase zinc-dependent  32.14 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1953  peptidase zinc-dependent  32.14 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.885912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3502  peptidase zinc-dependent  29.76 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1602  archaemetzincin-like protein  37.33 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2061  archaemetzincin-like protein  34.15 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0334  archaemetzincin-like protein  28.92 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.567826  normal  0.0385783 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2010  peptidase, zinc-dependent  30.95 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1746  peptidase zinc-dependent  21.11 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0914  Zn-dependent proteases-like  29.63 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.134032  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0828  archaemetzincin-like protein  35.96 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.687512  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1797  peptidase zinc-dependent  32.41 
 
 
176 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1076  peptidase, zinc-dependent  29.79 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.40633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>