37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1686 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1686  OsmC family protein  100 
 
 
141 aa  270  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1610  OsmC family protein  98.58 
 
 
141 aa  268  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2265  OsmC-like protein  90.65 
 
 
140 aa  213  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3583  OsmC family protein  41.61 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2314  OsmC family protein  48.86 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.401833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  31.36 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  31.09 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  26.83 
 
 
145 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  32.69 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  35.24 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  25.35 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  29.73 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  31.9 
 
 
190 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  23.76 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.43 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  31.82 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  31.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  31.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  29.03 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  31.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  31.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  31.36 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  30.09 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  31.4 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  28.81 
 
 
140 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  33.33 
 
 
182 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  31.36 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  26.61 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  33.33 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  29.73 
 
 
189 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  28.81 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  26.61 
 
 
183 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  28.57 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  29.09 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  27.45 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  32.69 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  28.81 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>