21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-3 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0042  tRNA-Met  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.873086  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0035  tRNA-Met  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0030  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0022  tRNA-Met  96.88 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.09062 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1376  tRNA-Met  88.46 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0049  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0034  tRNA-Met  92.31 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0022  tRNA-Met  90.7 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  90.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0015  tRNA-Met  100 
 
 		 103 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>