28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2237 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  100 
 
 
75 aa  151  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  86.67 
 
 
77 aa  137  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  66.67 
 
 
75 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  60 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  58.67 
 
 
83 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  61.19 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  58.21 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  54.93 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  53.52 
 
 
80 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  34.18 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  34.62 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
89 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  30.38 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  32.91 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  54.55 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  38.46 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  29.63 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  30.86 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>