More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2876 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  99.65 
 
 
286 aa  579  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  99.65 
 
 
286 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1412  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  84.91 
 
 
287 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2681  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  76.49 
 
 
288 aa  462  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1321  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  76.6 
 
 
288 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  72.63 
 
 
295 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.22 
 
 
294 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  42.21 
 
 
294 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  39.27 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.82 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.87 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
276 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 
293 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
276 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.67 
 
 
290 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  40.73 
 
 
300 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.52 
 
 
276 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  44.06 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
293 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
271 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.92 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  40.98 
 
 
271 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 
266 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  32.38 
 
 
264 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  32.38 
 
 
264 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  32.38 
 
 
264 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.38 
 
 
264 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  32.38 
 
 
264 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.8 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  33.45 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
264 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
264 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  40.21 
 
 
272 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 
264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.55 
 
 
266 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.55 
 
 
266 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.32 
 
 
264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
259 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.1 
 
 
266 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.1 
 
 
266 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41 
 
 
280 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
269 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.14 
 
 
335 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  41.05 
 
 
261 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  41.05 
 
 
261 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  37.82 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
259 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
264 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  39.9 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.13 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
267 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  41.05 
 
 
267 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  41.05 
 
 
267 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  41.05 
 
 
267 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
267 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  41.05 
 
 
267 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 
267 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 
263 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.25 
 
 
272 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.5 
 
 
277 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.6 
 
 
272 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  35.98 
 
 
542 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.41 
 
 
511 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.05 
 
 
268 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
341 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
341 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  39.09 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.05 
 
 
267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.98 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
293 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
274 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
293 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.62 
 
 
271 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
265 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
265 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.92 
 
 
245 aa  135  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.04 
 
 
533 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4429  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.64 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  37.75 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>