30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2298 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  363  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  98.84 
 
 		 172 aa  358  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  64.53 
 
 		 172 aa  248  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  56.07 
 
 		 175 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  43.29 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  42.68 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  44.37 
 
 		 148 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  40.85 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  43.05 
 
 		 152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  46.81 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  38.78 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  40.12 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2066  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000783821  hitchhiker  0.0000854583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  35.15 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  37.32 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  47.5 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  43.75 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3003  hypothetical protein  40.23 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  50.98 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>