28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1625 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1625  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  73.39 
 
 		 1268 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4398  hypothetical protein  67.86 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  98.17 
 
 		 2530 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1746  hypothetical protein  98.17 
 
 		 683 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0518263  hitchhiker  0.0000860028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  97.25 
 
 		 2545 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  98.15 
 
 		 2588 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  68.59 
 
 		 3040 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0577  putative adhesin  57.05 
 
 		 599 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  57.14 
 
 		 3350 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0575  hypothetical protein  48.68 
 
 		 1077 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0519  hypothetical protein  62.96 
 
 		 640 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.891503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  50.94 
 
 		 3862 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  52.63 
 
 		 2345 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  54.22 
 
 		 3300 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  52.53 
 
 		 3967 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  54.26 
 
 		 3790 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0054  hypothetical protein  53.47 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.369318  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  53.26 
 
 		 2600 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  36.11 
 
 		 1467 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  59.09 
 
 		 3602 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  52.34 
 
 		 3796 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32820  hypothetical protein  39.25 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000257187  hitchhiker  0.00000834291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2783  hypothetical protein  37.37 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000773934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2785  hypothetical protein  51.35 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  37.04 
 
 		 3443 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  39.55 
 
 		 5981 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1057  hypothetical protein  40.48 
 
 		 114 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.362414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>