286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1594 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  99.69 
 
 		 319 aa  648    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 319 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  99.37 
 
 		 319 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  66.88 
 
 		 319 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  66.04 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  65.72 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  59.94 
 
 		 321 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  60.19 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  59.87 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  60.19 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  59.56 
 
 		 324 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  58.04 
 
 		 320 aa  384  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  57.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  57.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  57.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  59.25 
 
 		 324 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  57.73 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  57.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  57.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  57.73 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  56.78 
 
 		 320 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  64.81 
 
 		 322 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  63.52 
 
 		 322 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  47.77 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  44.19 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  42.12 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  43.85 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  43.52 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  42.33 
 
 		 354 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  44.63 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  40.6 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  28.4 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  27.42 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  27.6 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  27.09 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  26.51 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.01 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  29.11 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  26.38 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  25.96 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  25.96 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  25.96 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  24.42 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  25.11 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  26.39 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  25.4 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  26.45 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  25.62 
 
 		 317 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  24.79 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  26.92 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.9 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  25.47 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1867  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.37 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  25.47 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  28.74 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1468  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.254511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2485  anthranilate phosphoribosyltransferase  22.32 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1872  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0732  anthranilate phosphoribosyltransferase  23.03 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1189  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.59 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0318107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.44 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0250  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.58 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  28.37 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1837  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.44 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2359  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>