More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0374 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0374  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1024    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0338  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  98.74 
 
 
477 aa  969    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1531  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  76.52 
 
 
478 aa  717    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00608  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  79.45 
 
 
476 aa  769    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0190  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.97 
 
 
512 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1893  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.63 
 
 
482 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674127  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2887  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.85 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1623  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.85 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02020  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.86 
 
 
485 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.641659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1834  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.38 
 
 
491 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1252  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.2 
 
 
491 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.588291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1438  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.83 
 
 
487 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779619  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1947  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  46.2 
 
 
489 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2867  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.81 
 
 
492 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23070  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  46.2 
 
 
489 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.273907  hitchhiker  0.000974114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5351  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.93 
 
 
485 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.031932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5259  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.42 
 
 
480 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.559368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1038  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.13 
 
 
491 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4486  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.4 
 
 
499 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0778  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.87 
 
 
491 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2489  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.92 
 
 
490 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0728  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.87 
 
 
491 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.833779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1866  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.01 
 
 
490 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0363  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.27 
 
 
491 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2741  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.67 
 
 
491 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2046  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.49 
 
 
490 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106062  normal  0.251216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1929  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.49 
 
 
490 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.137713  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2151  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.74 
 
 
490 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.013826  normal  0.219561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1812  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.35 
 
 
490 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000273769  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2539  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.95 
 
 
490 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0535577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2130  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.7 
 
 
490 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00145031  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3956  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.44 
 
 
491 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0395  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.83 
 
 
491 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329299  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0300  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.03 
 
 
491 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0465  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.66 
 
 
499 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2175  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.7 
 
 
490 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.949552  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2254  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.7 
 
 
490 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000217309  hitchhiker  0.0000019456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17630  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.81 
 
 
488 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2079  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.37 
 
 
490 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4527  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.7 
 
 
490 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3905  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.52 
 
 
490 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16620  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  45.81 
 
 
487 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2241  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.7 
 
 
490 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4822  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.66 
 
 
493 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.712269  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6228  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.04 
 
 
488 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0798  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.05 
 
 
489 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5128  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.49 
 
 
480 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1125  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.7 
 
 
490 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0159  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.68 
 
 
490 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.580754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0653  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.82 
 
 
503 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.919575  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0480  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.53 
 
 
492 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27260  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.95 
 
 
489 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2048  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.59 
 
 
490 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000103932  normal  0.421774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5400  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.87 
 
 
480 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.887307  normal  0.016142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0516  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.47 
 
 
492 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.455459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2642  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.5 
 
 
491 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71800  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.83 
 
 
488 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3374  Glucose-6-phosphate dehydrogenase  42.86 
 
 
491 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00871794  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5801  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.18 
 
 
496 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.167036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1704  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.66 
 
 
505 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2335  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.15 
 
 
498 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5329  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.18 
 
 
482 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0545  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.32 
 
 
535 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1300  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.74 
 
 
489 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2070  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.24 
 
 
490 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000903154  hitchhiker  0.000676644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0751  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.21 
 
 
489 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.459957  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4431  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.21 
 
 
487 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3143  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  44.7 
 
 
488 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.604017  normal  0.0129943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1120  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.12 
 
 
489 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.670667  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4363  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.86 
 
 
488 aa  358  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1017  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.2 
 
 
491 aa  358  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1892  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.58 
 
 
489 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7068  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.4 
 
 
492 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7022  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.4 
 
 
514 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.533798  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1559  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.4 
 
 
489 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.215832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1096  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.08 
 
 
488 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.130518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4202  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  42.58 
 
 
489 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2022  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.86 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3790  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.3 
 
 
489 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2134  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.86 
 
 
494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4867  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  43.3 
 
 
489 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.911701  normal  0.0866377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4742  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.53 
 
 
492 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0025  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.2 
 
 
495 aa  352  8e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1789  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00188919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2281  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.31 
 
 
489 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0036441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1335  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  352  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.606999  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0483  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.69 
 
 
496 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2082  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  352  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1944  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  352  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1780  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.093662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2587  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0488921  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2412  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.86 
 
 
494 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0459  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.81 
 
 
496 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2768  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.65 
 
 
491 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116364  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2136  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  40.43 
 
 
491 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01244  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.15 
 
 
497 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01823  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0889868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01811  hypothetical protein  39.87 
 
 
491 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.12369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3387  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  41.94 
 
 
485 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2127  glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  39.87 
 
 
491 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>