21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1431 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  772    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  98.57 
 
 
295 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1336  hypothetical protein  89.44 
 
 
171 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.513021  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1435  hypothetical protein  52.75 
 
 
256 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1130  hypothetical protein  35.03 
 
 
310 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.3984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1835  hypothetical protein  46.51 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4689  hypothetical protein  31.76 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0188  hypothetical protein  37.5 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4006  hypothetical protein  45.26 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464817  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1758  hypothetical protein  52.31 
 
 
323 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  34.26 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  32.48 
 
 
285 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3621  hypothetical protein  48.39 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0768512  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0578  hypothetical protein  45.71 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.044729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1736  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1931  hypothetical protein  34.88 
 
 
258 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0476094  hitchhiker  0.0000000997177 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1064  hypothetical protein  41.79 
 
 
164 aa  54.3  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  29.91 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  35.9 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  32.5 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2167  hypothetical protein  31.97 
 
 
241 aa  43.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>