22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3215 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  736    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  63.75 
 
 
345 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  55.71 
 
 
350 aa  309  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  49.83 
 
 
332 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  39.94 
 
 
324 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  40.24 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  32.89 
 
 
332 aa  103  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  33.56 
 
 
332 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  33.82 
 
 
336 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  36.4 
 
 
334 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  29.79 
 
 
333 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  32.09 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  33.45 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  38.84 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  36.99 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  34.75 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  37.23 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  35.27 
 
 
353 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  27.82 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  31.29 
 
 
182 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2993  hypothetical protein  29.89 
 
 
511 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.300626  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  45.45 
 
 
164 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>