15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0325 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0325  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  53.21 
 
 
239 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  47.53 
 
 
243 aa  88.6  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  47.14 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  36.04 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  44 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  40.45 
 
 
270 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  40.91 
 
 
282 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  41.67 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  44.86 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  35.91 
 
 
448 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  37.21 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  40 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  33.73 
 
 
270 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  44.44 
 
 
263 aa  42  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>