25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0148 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  100 
 
 
2553 aa  5140    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.18 
 
 
2724 aa  1596    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  28.6 
 
 
3911 aa  121  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0375  hypothetical protein  26.41 
 
 
2320 aa  89  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  35 
 
 
2395 aa  58.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  23.94 
 
 
3471 aa  54.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.22 
 
 
924 aa  53.9  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  29.74 
 
 
807 aa  53.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  30.45 
 
 
1533 aa  49.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  28.67 
 
 
8918 aa  49.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  31.43 
 
 
983 aa  48.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  27.65 
 
 
2489 aa  49.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  30.45 
 
 
2113 aa  49.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  22.92 
 
 
2490 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  27.31 
 
 
2281 aa  48.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  31.25 
 
 
1898 aa  48.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  31.46 
 
 
1516 aa  48.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  28.64 
 
 
1150 aa  48.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  27.55 
 
 
2121 aa  48.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  26.41 
 
 
1118 aa  47.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26.57 
 
 
5010 aa  47.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  30.45 
 
 
2520 aa  47.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  30.45 
 
 
2520 aa  47  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00820  putative collagen-binding protein  28.97 
 
 
764 aa  46.6  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0774638  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  29.46 
 
 
1857 aa  46.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>