169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2401 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  100 
 
 		 234 aa  460  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  60.96 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  58.71 
 
 		 210 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  58.12 
 
 		 208 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  58.42 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  55.22 
 
 		 211 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  56.99 
 
 		 213 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  59.34 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  50.52 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  51.58 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  51.58 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  51.35 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  50 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  48.72 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  48.48 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  50.81 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  48.24 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  48.48 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  46.07 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1188  Colicin V production protein  46.89 
 
 		 208 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  47.89 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  44.65 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1043  Colicin V production protein  45.15 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  45.36 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4630  Colicin V production protein  46.81 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  33.62 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0488  CvpA protein  41.79 
 
 		 155 aa  90.9  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.888997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  29.34 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  32.2 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1711  colicin V production protein  32.78 
 
 		 189 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  32 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  32.69 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  28.82 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2130  putative colicin V production protein  32.18 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  28.1 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  28.1 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  28.1 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  29.68 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  27.45 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  30.16 
 
 		 180 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  28.09 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  26.78 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  29.87 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  33.56 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  28.57 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1785  colicin V production protein  37.21 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.170102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  30.92 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  26.22 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  32.38 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  31.53 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  31.53 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1805  colicin V production protein  28.29 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2455  putative colicin V production protein, dedE  30.29 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1118  colicin V production protein  30.29 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.439465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  31.06 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  28.92 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  28.57 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  32.2 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  29.41 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  28.1 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  26.62 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  29.01 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  26.92 
 
 		 160 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  31.36 
 
 		 169 aa  62  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  31.36 
 
 		 169 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  31.36 
 
 		 169 aa  62  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  32.14 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  30.17 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  26.92 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  33.05 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  30.51 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  27.38 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  32.71 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  30.51 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1063  colicin V production protein  29.89 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  24.79 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  24.79 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  29.06 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  28.75 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  32 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  28.48 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  26.14 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  32.12 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  25 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  29.11 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1206  colicin V production protein  28.38 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0900  colicin V production protein  25.17 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>