27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1477 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1477  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  296  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1127  hypothetical protein  54.84 
 
 
129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0614776  normal  0.694402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4328  hypothetical protein  58.82 
 
 
125 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363199 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4016  hypothetical protein  53.12 
 
 
125 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2380  hypothetical protein  57.84 
 
 
146 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1242  hypothetical protein  60.82 
 
 
129 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1260  hypothetical protein  57.84 
 
 
125 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2701  hypothetical protein  46.62 
 
 
163 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0364226  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2615  hypothetical protein  47.22 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0733143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0962  hypothetical protein  48.41 
 
 
123 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0665  hypothetical protein  46.23 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0671  hypothetical protein  46.23 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1168  hypothetical protein  42.96 
 
 
140 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1016  hypothetical protein  43.85 
 
 
148 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.586424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0709  putative signal peptide protein  49.52 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1064  hypothetical protein  47.52 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.589479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0715  hypothetical protein  43.4 
 
 
214 aa  96.7  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3985  hypothetical protein  47.52 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  decreased coverage  0.00103127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4669  hypothetical protein  45.92 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4300  hypothetical protein  45.92 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4818  hypothetical protein  46.94 
 
 
151 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  0.143523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2096  hypothetical protein  44.9 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0697301  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1090  hypothetical protein  38.95 
 
 
229 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1465  hypothetical protein  40.71 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0757  hypothetical protein  41.11 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0823  hypothetical protein  32.58 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.32462  hitchhiker  0.000215418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4418  hypothetical protein  29.57 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>