14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0781 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  100 
 
 
886 aa  1724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2986  hypothetical protein  41.04 
 
 
884 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.262988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3104  hypothetical protein  41.15 
 
 
884 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238928  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0036  hypothetical protein  41.8 
 
 
886 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1996  hypothetical protein  39.48 
 
 
884 aa  525  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.573803  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5413  hypothetical protein  41.21 
 
 
886 aa  525  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.871624  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.04 
 
 
1048 aa  62.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  27.13 
 
 
986 aa  48.9  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  29.87 
 
 
266 aa  48.1  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  33.33 
 
 
311 aa  45.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  31.14 
 
 
1045 aa  45.1  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  41.33 
 
 
303 aa  44.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  43.06 
 
 
295 aa  44.3  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  34.23 
 
 
273 aa  44.3  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>