16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4357 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4357  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2432  hypothetical protein  73.73 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0933223  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2788  hypothetical protein  67.26 
 
 
206 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2278  hypothetical protein  67.26 
 
 
206 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2209  hypothetical protein  59.7 
 
 
236 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3028  hypothetical protein  67.26 
 
 
223 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134769  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1805  hypothetical protein  61.19 
 
 
233 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0148188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3596  hypothetical protein  65.49 
 
 
207 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1435  hypothetical protein  46.01 
 
 
183 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2710  putative signal peptide protein  52.04 
 
 
146 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.122349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1366  putative signal peptide protein  43.16 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2156  putative signal peptide protein  34.62 
 
 
184 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120946  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2330  signal peptide protein  32.18 
 
 
178 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2491  putative signal peptide protein  32.05 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1832  signal peptide protein  33.33 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830252  normal  0.442369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2001  signal peptide protein  33.33 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  0.420987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>