25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2596 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2596  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.292698  normal  0.0948228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  53.68 
 
 
162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  55.43 
 
 
191 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  52.69 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  47.37 
 
 
175 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  36.46 
 
 
190 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5296  hypothetical protein  36.67 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5563  hypothetical protein  36.67 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6546  hypothetical protein  37.88 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3876  hypothetical protein  34.41 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1181  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.120079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  32.63 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  32.97 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  32.29 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  29.67 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  26.14 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  26.14 
 
 
191 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  24.72 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  35 
 
 
165 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  28.21 
 
 
135 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  22.11 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  33.75 
 
 
138 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>